Bacteriochlorophyll (4BCL) Optimize positions of hydrogen atoms using PM7

Toggle display all Toggle center picture
Console Fit to screen
Near Neighbors Connected Neighbors
Charges as Nos. Charges as Sizes
Common Script   (Read file from:
"common.txt")
Specific Script   (Read file from:
"Bacteriochlorophyll (4BCL).txt")

Toggle Individual Residues

T
8

T
9

T
10

A
11

H
12

S
13

D
14

Y
15

E
16

I
17

I
18

L
19

E
20

G
21

G
22

S
23

S
24

S
25

W
26

G
27

Q
28

V
29

K
30

G
31

R
32

A
33

K
34

V
35

N
36

V
37

P
38

A
39

A
40

I
41

P
42

L
43

L
44

P
45

T
46

D
47

C
48

N
49

I
50

R
51

I
52

D
53

A
54

K
55

P
56

L
57

D
58

G
62

V
63

V
64

R
65

F
66

T
67

T
68

K
69

I
70

E
71

S
72

V
73

V
74

D
75

S
76

V
77

K
78

N
79

T
80

L
81

N
82

V
83

E
84

V
85

D
86

I
87

A
88

N
89

E
90

T
91

K
92

D
93

R
94

R
95

I
96

A
97

V
98

G
99

E
100

G
101

S
102

L
103

S
104

V
105

G
106

D
107

F
108

S
109

H
110

S
111

F
112

S
113

F
114

E
115

G
116

S
117

V
118

V
119

N
120

M
121

Y
122

Y
123

Y
124

R
125

S
126

D
127

A
128

V
129

R
130

R
131

N
132

I
133

P
134

N
135

P
136

I
137

Y
138

M
139

Q
140

G
141

R
142

Q
143

F
144

H
145

D
146

I
147

L
148

M
149

K
150

V
151

P
152

L
153

D
154

N
155

N
156

D
157

L
158

V
159

D
160

T
161

W
162

E
163

G
164

F
165

Q
166

Q
167

S
168

I
169

G
173

A
174

N
175

F
176

G
177

D
178

W
179

I
180

R
181

E
182

F
183

W
184

F
185

I
186

G
187

P
188

A
189

F
190

A
191

A
192

I
193

N
194

E
195

G
196

G
197

Q
198

R
199

I
200

S
201

P
202

I
203

V
204

V
205

N
206

S
207

S
208

N
209

V
210

E
211

G
212

G
216

P
217

V
218

G
219

V
220

T
221

R
222

W
223

K
224

F
225

S
226

H
227

A
228

G
229

S
230

G
231

V
232

V
233

D
234

S
235

I
236

S
237

R
238

W
239

T
240

E
241

L
242

F
243

P
244

V
245

E
246

Q
247

L
248

N
249

K
250

P
251

A
252

S
253

I
254

E
255

G
256

G
257

F
258

R
259

S
260

D
261

S
262

Q
263

G
264

I
265

E
266

V
267

K
268

V
269

D
270

G
271

N
272

L
273

P
274

G
275

V
276

S
277

R
278

D
279

A
280

G
281

G
282

G
283

L
284

R
285

R
286

I
287

L
288

N
289

H
290

P
291

L
292

I
293

P
294

L
295

V
296

H
297

H
298

G
299

M
300

V
301

G
302

K
303

F
304

N
305

D
306

F
307

T
308

V
309

D
310

T
311

Q
312

L
313

K
314

I
315

V
316

L
317

P
318

K
319

G
320

Y
321

K
322

I
323

R
324

Y
325

A
326

A
327

P
328

Q
329

F
330

R
331

S
332

Q
333

N
334

L
335

E
336

E
337

Y
338

R
339

W
340

S
341

G
342

G
343

A
344

Y
345

A
346

R
347

W
348

V
349

E
350

H
351

V
352

C
353

K
354

G
355

G
356

T
357

G
358

Q
359

F
360

E
361

V
362

L
363

Y
364

A
365

Q
366

X
1

X
6

X
4

X
7

X
3

X
2

X
5

Date:     Aug 4 2021 17:58
No. atoms:      6729
Formula:     C2107H3425N509O675S6Mg7
Net charge:     Zero
Heat of Formation:      -36494.287 Kcal/mol